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Gene and Protein Information ![]() |
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Species | TM | P Loops | AA | Chromosomal Location | Gene Symbol | Gene Name | Reference |
Human | 6 | 1 | 805 | 10q24.31 | PKD2L1 | polycystin 2 like 1, transient receptor potential cation channel | 4,9-10 |
Mouse | 6 | 1 | 760 | 19 C3 | Pkd2l1 | polycystic kidney disease 2-like 1 | 8-9 |
Rat | 6 | 1 | 676 | 1q56 | Pkd2l1 | polycystin 2 like 1, transient receptor potential cation channel |
Database Links ![]() |
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Alphafold | Q9P0L9 (Hs) |
Ensembl Gene | ENSG00000107593 (Hs), ENSMUSG00000037578 (Mm), ENSRNOG00000012591 (Rn) |
Entrez Gene | 9033 (Hs), 329064 (Mm), 293937 (Rn) |
Human Protein Atlas | ENSG00000107593 (Hs) |
KEGG Gene | hsa:9033 (Hs), mmu:329064 (Mm), rno:293937 (Rn) |
OMIM | 604532 (Hs) |
Pharos | Q9P0L9 (Hs) |
RefSeq Nucleotide | NM_016112 (Hs), NM_181422 (Mm), NM_001106352 (Rn) |
RefSeq Protein | NP_057196 (Hs), NP_852087 (Mm), NP_001099822 (Rn) |
UniProtKB | Q9P0L9 (Hs) |
Wikipedia | PKD2L1 (Hs) |
Associated Proteins ![]() |
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Functional Characteristics ![]() |
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Currents have been measured directly from primary cilia and also when expressed on plasma membranes. Primary cilia appear to contain heteromeric TRPP2 + PKD1-L1, underlying a gently outwardly rectifying nonselective conductance (PCa/PNa ~6: PKD1-L1 is a 12 TM protein of unknown topology). Primary cilia heteromeric channels have an inward single channel conductance of 80 pS and an outward single channel conductance of 95 pS. Presumed homomeric TRPP2 channels are gently outwardly rectifying. Single channel conductance is 120 pS inward, 200 pS outward [2]. TRPP2 (PKD2L1) displays calcium dependent activation. Calcium accumulation due to prolonged channel activity may lead to outward-moving Ca2+ ions to close the channel [3]. |
Ion Selectivity and Conductance ![]() |
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Activators (Human) |
Calmidazolium (in primary cilia): 10 µM |
Download all structure-activity data for this target as a CSV file
Activators | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Activator Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Chen et al [1] expressed human TRPP2 in Xenopus oocytes and proposed increased currents on increasing external or (inferred) internal Ca2+ levels and noted a decrease in channel activity on lowering external pH (7.5>6). TRPP2 and PKD1L3 are coexpressed in sour taste receptor cells of the tongue. Coexpression of the PDK1L3 and TRPP2 is necessary for functional cell surface expression, presumably as a heteromeric complex, where they are activated by acid pH [6]. |
Channel Blockers | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Channel Blocker Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
The block refers to the inhibition of the presumed current carried by human TRPP2 in Xenopus laevis oocytes. |
Tissue Distribution ![]() |
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Functional Assays ![]() |
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Physiological Functions ![]() |
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Clinically-Relevant Mutations and Pathophysiology Comments |
TRPP2 is deleted in the Krd mouse. This mouse has defects in structures of the kidney, retina and optic disc, however the Krd deletion is a 7cM transgene-induce deletion on chromosome 19 that includes the Pax2 locus [9]. |
1. Chen XZ, Vassilev PM, Basora N, Peng JB, Nomura H, Segal Y, Brown EM, Reeders ST, Hediger MA, Zhou J. (1999) Polycystin-L is a calcium-regulated cation channel permeable to calcium ions. Nature, 401 (6751): 383-6. [PMID:10517637]
2. DeCaen PG, Delling M, Vien TN, Clapham DE. (2013) Direct recording and molecular identification of the calcium channel of primary cilia. Nature, 504 (7479): 315-8. [PMID:24336289]
3. DeCaen PG, Liu X, Abiria S, Clapham DE. (2016) Atypical calcium regulation of the PKD2-L1 polycystin ion channel. Elife, 5. [PMID:27348301]
4. Guo L, Chen M, Basora N, Zhou J. (2000) The human polycystic kidney disease 2-like (PKDL) gene: exon/intron structure and evidence for a novel splicing mechanism. Mamm Genome, 11 (1): 46-50. [PMID:10602992]
5. Huang AL, Chen X, Hoon MA, Chandrashekar J, Guo W, Tränkner D, Ryba NJ, Zuker CS. (2006) The cells and logic for mammalian sour taste detection. Nature, 442 (7105): 934-8. [PMID:16929298]
6. Ishimaru Y, Inada H, Kubota M, Zhuang H, Tominaga M, Matsunami H. (2006) Transient receptor potential family members PKD1L3 and PKD2L1 form a candidate sour taste receptor. Proc Natl Acad Sci USA, 103 (33): 12569-74. [PMID:16891422]
7. LopezJimenez ND, Cavenagh MM, Sainz E, Cruz-Ithier MA, Battey JF, Sullivan SL. (2006) Two members of the TRPP family of ion channels, Pkd1l3 and Pkd2l1, are co-expressed in a subset of taste receptor cells. J Neurochem, 98 (1): 68-77. [PMID:16805797]
8. Murakami M, Ohba T, Xu F, Shida S, Satoh E, Ono K, Miyoshi I, Watanabe H, Ito H, Iijima T. (2005) Genomic organization and functional analysis of murine PKD2L1. J Biol Chem, 280 (7): 5626-35. [PMID:15548533]
9. Nomura H, Turco AE, Pei Y, Kalaydjieva L, Schiavello T, Weremowicz S, Ji W, Morton CC, Meisler M, Reeders ST et al.. (1998) Identification of PKDL, a novel polycystic kidney disease 2-like gene whose murine homologue is deleted in mice with kidney and retinal defects. J Biol Chem, 273 (40): 25967-73. [PMID:9748274]
10. Wu G, Hayashi T, Park JH, Dixit M, Reynolds DM, Li L, Maeda Y, Cai Y, Coca-Prados M, Somlo S. (1998) Identification of PKD2L, a human PKD2-related gene: tissue-specific expression and mapping to chromosome 10q25. Genomics, 54 (3): 564-8. [PMID:9878261]