Top ▲
Gene and Protein Information  |
||||||
| Species | TM | AA | Chromosomal Location | Gene Symbol | Gene Name | Reference |
| Human | 1 | 501 | 11q23.3 | BACE1 | beta-secretase 1 | |
| Mouse | 1 | 501 | 9 A5.2 | Bace1 | beta-site APP cleaving enzyme 1 | |
| Rat | 1 | 501 | 8q22 | Bace1 | beta-secretase 1 | |
| Previous and Unofficial Names |
| APP beta-secretase | ASP2 | aspartyl protease 2 | Bace | beta-site amyloid precursor protein cleaving enzyme 1 | memapsin-2 | beta-site APP-cleaving enzyme 1 |
| Selected 3D Structures |
|||||||||||||
|
|
||||||||||||
|
|
||||||||||||
| Enzyme Reaction |
||||
|
||||
Download all structure-activity data for this target as a CSV file 
| Inhibitors | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Key to terms and symbols | View all chemical structures | Click column headers to sort | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| View species-specific inhibitor tables | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
1. Blass B. (2012) Compounds and Their Use as BACE Inhibitors: Patent Highlight. ACS Med Chem Lett, 3 (11): 875-6. [PMID:24900397]
2. Blass B. (2013) Cyclopropyl-Fused 1,3-Thiazepines as BACE1 and BACE2 Inhibitors. ACS Med Chem Lett, 4 (4): 379-80. [PMID:24900681]
3. Cheng Y, Brown J, Judd TC, Lopez P, Qian W, Powers TS, Chen JJ, Bartberger MD, Chen K, Dunn 2nd RT et al.. (2015) An Orally Available BACE1 Inhibitor That Affords Robust CNS Aβ Reduction without Cardiovascular Liabilities. ACS Med Chem Lett, 6 (2): 210-5. [PMID:25699151]
4. Dineen TA, Chen K, Cheng AC, Derakhchan K, Epstein O, Esmay J, Hickman D, Kreiman CE, Marx IE, Wahl RC et al.. (2014) Inhibitors of β-site amyloid precursor protein cleaving enzyme (BACE1): identification of (S)-7-(2-fluoropyridin-3-yl)-3-((3-methyloxetan-3-yl)ethynyl)-5'H-spiro[chromeno[2,3-b]pyridine-5,4'-oxazol]-2'-amine (AMG-8718). J Med Chem, 57 (23): 9811-31. [PMID:25363711]
5. Eketjäll S, Janson J, Jeppsson F, Svanhagen A, Kolmodin K, Gustavsson S, Radesäter AC, Eliason K, Briem S, Appelkvist P et al.. (2013) AZ-4217: a high potency BACE inhibitor displaying acute central efficacy in different in vivo models and reduced amyloid deposition in Tg2576 mice. J Neurosci, 33 (24): 10075-84. [PMID:23761903]
6. Esterházy D, Stützer I, Wang H, Rechsteiner MP, Beauchamp J, Döbeli H, Hilpert H, Matile H, Prummer M, Schmidt A et al.. (2011) Bace2 is a β cell-enriched protease that regulates pancreatic β cell function and mass. Cell Metab, 14 (3): 365-77. [PMID:21907142]
7. Fukumoto H, Takahashi H, Tarui N, Matsui J, Tomita T, Hirode M, Sagayama M, Maeda R, Kawamoto M, Hirai K et al.. (2010) A noncompetitive BACE1 inhibitor TAK-070 ameliorates Abeta pathology and behavioral deficits in a mouse model of Alzheimer's disease. J Neurosci, 30 (33): 11157-66. [PMID:20720123]
8. Ghosh AK, Brindisi M, Yen YC, Lendy EK, Kovela S, Cárdenas EL, Reddy BS, Rao KV, Downs D, Huang X et al.. (2019) Highly Selective and Potent Human β-Secretase 2 (BACE2) Inhibitors against Type 2 Diabetes: Design, Synthesis, X-ray Structure and Structure-Activity Relationship Studies. ChemMedChem, 14 (5): 545-560. [PMID:30637955]
9. Ghosh AK, Kumaragurubaran N, Hong L, Kulkarni SS, Xu X, Chang W, Weerasena V, Turner R, Koelsch G, Bilcer G et al.. (2007) Design, synthesis, and X-ray structure of potent memapsin 2 (beta-secretase) inhibitors with isophthalamide derivatives as the P2-P3-ligands. J Med Chem, 50 (10): 2399-407. [PMID:17432843]
10. Hilpert H, Guba W, Woltering TJ, Wostl W, Pinard E, Mauser H, Mayweg AV, Rogers-Evans M, Humm R, Krummenacher D et al.. (2013) β-Secretase (BACE1) inhibitors with high in vivo efficacy suitable for clinical evaluation in Alzheimer's disease. J Med Chem, 56 (10): 3980-95. [PMID:23590342]
11. Holenz J et al. (2011) 5h-pyrrolo[3,4- gbp >]pyrazin-7-amine derivatives inhibitors of beta-secretase. Patent number: WO2011002409. Assignee: AstraZeneca. Priority date: 03/07/2009. Publication date: 06/01/2011.
12. Jacobsen H, Ozmen L, Caruso A, Narquizian R, Hilpert H, Jacobsen B, Terwel D, Tanghe A, Bohrmann B. (2014) Combined treatment with a BACE inhibitor and anti-Aβ antibody gantenerumab enhances amyloid reduction in APPLondon mice. J Neurosci, 34 (35): 11621-30. [PMID:25164658]
13. Jeppsson F, Eketjäll S, Janson J, Karlström S, Gustavsson S, Olsson LL, Radesäter AC, Ploeger B, Cebers G, Kolmodin K et al.. (2012) Discovery of AZD3839, a potent and selective BACE1 inhibitor clinical candidate for the treatment of Alzheimer disease. J Biol Chem, 287 (49): 41245-57. [PMID:23048024]
14. Juichi, S et al.. (2009) Fused aminodihydrothiazine derivatives. Patent number: US20090209755. Assignee: Eisai. Priority date: 18/01/2008. Publication date: 20/08/2009.
15. Koriyama, Y. Discovery and synthesis of JNJ-54861911, a novel orally active BACE1 inhibitor. Accessed on 28/05/2018. Modified on 28/05/2018. CiteUlike, http://www.citeulike.org/user/cdsouthan/article/14595136
16. Machauer R, Lueoend R, Hurth K, Veenstra SJ, Rueeger H, Voegtle M, Tintelnot-Blomley M, Rondeau JM, Jacobson LH, Laue G et al.. (2021) Discovery of Umibecestat (CNP520): A Potent, Selective, and Efficacious β-Secretase (BACE1) Inhibitor for the Prevention of Alzheimer's Disease. J Med Chem, 64 (20): 15262-15279. [PMID:34648711]
17. Mandal M, Wu Y, Misiaszek J, Li G, Buevich A, Caldwell JP, Liu X, Mazzola RD, Orth P, Strickland C et al.. (2016) Structure-Based Design of an Iminoheterocyclic β-Site Amyloid Precursor Protein Cleaving Enzyme (BACE) Inhibitor that Lowers Central Aβ in Nonhuman Primates. J Med Chem, 59 (7): 3231-48. [PMID:26937601]
18. May P, Boggs L, Brier R, Calligaro D, Citron M, Day T, Lin S, Lindstrom T, Mergott D, Monk S et al.. (2012) Preclinical characterizathion of LY2886721: A BACE1 inhibitor in clinical development for early Alzheimer's disease. Alzheimers Dement, 8 (4): 95.
19. May PC, Dean RA, Lowe SL, Martenyi F, Sheehan SM, Boggs LN, Monk SA, Mathes BM, Mergott DJ, Watson BM et al.. (2011) Robust central reduction of amyloid-β in humans with an orally available, non-peptidic β-secretase inhibitor. J Neurosci, 31 (46): 16507-16. [PMID:22090477]
20. McKinzie DL, Winneroski LL, Green SJ, Hembre EJ, Erickson JA, Willis BA, Monk SA, Aluise CD, Baker TK, Lopez JE et al.. (2021) Discovery and Early Clinical Development of LY3202626, a Low-Dose, CNS-Penetrant BACE Inhibitor. J Med Chem, 64 (12): 8076-8100. [PMID:34081466]
21. Neumann U, Rueeger H, Machauer R, Veenstra SJ, Lueoend RM, Tintelnot-Blomley M, Laue G, Beltz K, Vogg B, Schmid P et al.. (2015) A novel BACE inhibitor NB-360 shows a superior pharmacological profile and robust reduction of amyloid-β and neuroinflammation in APP transgenic mice. Mol Neurodegener, 10: 44. [PMID:26336937]
22. O'Neill BT, Beck EM, Butler CR, Nolan CE, Gonzales C, Zhang L, Doran SD, Lapham K, Buzon LM, Dutra JK et al.. (2018) Design and Synthesis of Clinical Candidate PF-06751979: A Potent, Brain Penetrant, β-Site Amyloid Precursor Protein Cleaving Enzyme 1 (BACE1) Inhibitor Lacking Hypopigmentation. J Med Chem, 61 (10): 4476-4504. [PMID:29613789]
23. Pettus LH, Bourbeau MP, Bradley J, Bartberger MD, Chen K, Hickman D, Johnson M, Liu Q, Manning JR, Nanez A et al.. (2020) Discovery of AM-6494: A Potent and Orally Efficacious β-Site Amyloid Precursor Protein Cleaving Enzyme 1 (BACE1) Inhibitor with in Vivo Selectivity over BACE2. J Med Chem, 63 (5): 2263-2281. [PMID:31589043]
24. Rombouts FJR, Kusakabe KI, Alexander R, Austin N, Borghys H, De Cleyn M, Dhuyvetter D, Gijsen HJM, Hrupka B, Jacobs T et al.. (2021) JNJ-67569762, A 2-Aminotetrahydropyridine-Based Selective BACE1 Inhibitor Targeting the S3 Pocket: From Discovery to Clinical Candidate. J Med Chem, 64 (19): 14175-14191. [PMID:34553934]
25. Rueeger H, Lueoend R, Machauer R, Veenstra SJ, Jacobson LH, Staufenbiel M, Desrayaud S, Rondeau JM, Möbitz H, Neumann U. (2013) Discovery of cyclic sulfoxide hydroxyethylamines as potent and selective β-site APP-cleaving enzyme 1 (BACE1) inhibitors: structure based design and in vivo reduction of amyloid β-peptides. Bioorg Med Chem Lett, 23 (19): 5300-6. [PMID:23981898]
26. Scott JD et al.. (2015) Iminothiadiazine dioxide compounds as BACE inhibitors, compositions, and their use. Patent number: US8940748. Assignee: Merck Sharp & Dohme. Priority date: 08/10/2009. Publication date: 27/01/2015.
27. Stamford AW, Scott JD, Li SW, Babu S, Tadesse D, Hunter R, Wu Y, Misiaszek J, Cumming JN, Gilbert EJ et al.. (2012) Discovery of an Orally Available, Brain Penetrant BACE1 Inhibitor that Affords Robust CNS Aβ Reduction. ACS Med Chem Lett, 3 (11): 897-902. [PMID:23412139]
28. Ueno T, Matsuoka E, Asada N, Yamamoto S, Kanegawa N, Ito M, Ito H, Moechars D, Rombouts FJR, Gijsen HJM et al.. (2021) Discovery of Extremely Selective Fused Pyridine-Derived β-Site Amyloid Precursor Protein-Cleaving Enzyme (BACE1) Inhibitors with High In Vivo Efficacy through 10s Loop Interactions. J Med Chem, 64 (19): 14165-14174. [PMID:34553947]
29. Wood S, Wen PH, Zhang J, Zhu L, Luo Y, Babu-Khan S, Chen K, Pham R, Esmay J, Dineen TA et al.. (2012) Establishing the relationship between in vitro potency, pharmacokinetic, and pharmacodynamic parameters in a series of orally available, hydroxyethylamine-derived β-secretase inhibitors. J Pharmacol Exp Ther, 343 (2): 460-7. [PMID:22911925]
30. Zhang L, Chen L, Dutra JK, Beck EM, Nag S, Takano A, Amini N, Arakawa R, Brodney MA, Buzon LM et al.. (2018) Identification of a Novel Positron Emission Tomography (PET) Ligand for Imaging β-Site Amyloid Precursor Protein Cleaving Enzyme 1 (BACE-1) in Brain. J Med Chem, 61 (8): 3296-3308. [PMID:29356535]
A1: Pepsin: beta-secretase 1. Last modified on 08/07/2024. Accessed on 16/10/2024. IUPHAR/BPS Guide to PHARMACOLOGY, https://www.guidetopharmacology.org/GRAC/ObjectDisplayForward?objectId=2330.
