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Gene and Protein Information | |||||||
Species | TM | P Loops | AA | Chromosomal Location | Gene Symbol | Gene Name | Reference |
Human | 24 | 4 | 2005 | 2q24.3 | SCN2A | sodium voltage-gated channel alpha subunit 2 | 2,49 |
Mouse | 24 | 4 | 2006 | 2 C1.3 | Scn2a | sodium channel, voltage-gated, type II, alpha | |
Rat | 24 | 4 | 2005 | 3q21 | Scn2a | sodium voltage-gated channel alpha subunit 2 | 3,37 |
Database Links | |
Alphafold | Q99250 (Hs), P04775 (Rn) |
ChEMBL Target | CHEMBL4187 (Hs), CHEMBL3399 (Rn) |
DrugBank Target | Q99250 (Hs) |
Ensembl Gene | ENSG00000136531 (Hs), ENSMUSG00000075318 (Mm), ENSRNOG00000005018 (Rn) |
Entrez Gene | 6326 (Hs), 110876 (Mm), 24766 (Rn) |
Human Protein Atlas | ENSG00000136531 (Hs) |
KEGG Gene | hsa:6326 (Hs), mmu:110876 (Mm), rno:24766 (Rn) |
OMIM | 182390 (Hs) |
Orphanet | ORPHA118500 (Hs) |
Pharos | Q99250 (Hs) |
RefSeq Nucleotide | NM_001040142 (Hs), NM_001040143 (Hs), NM_001099298 (Mm), NM_012647 (Rn) |
RefSeq Protein | NP_001035233 (Hs), NP_001035232 (Hs), NP_001092768 (Mm), NP_036779 (Rn) |
UniProtKB | Q99250 (Hs), P04775 (Rn) |
Wikipedia | SCN2A (Hs) |
Selected 3D Structures | |||||||||||
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Associated Proteins | ||||||||||||||||||||||
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Associated Protein Comments | ||||||||||||||||||||||
β-3 and β-4 subunits also associate with Nav1.2 channels when co-expressed but there are no direct biochemical data on purified sodium channels at present [28,32,51]. |
Functional Characteristics | |
Activation V0.5 = -24 mV. Fast inactivation (τ = 0.8 ms for peak sodium current). |
Ion Selectivity and Conductance | ||||||
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Voltage Dependence | ||||||||||||||||||||||
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Voltage Dependence Comments | ||||||||||||||||||||||
The values given for activation and inactivation parameters are for α-subunits expressed alone in mammalian cells. Co-expression of β-subunits shifts the voltage dependence [32], as does the use of intracellular solutions with other major anions (see table). |
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Activators | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Activator Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Veratridine and aconitine have been studied on sodium channels in synaptosomes, which are predominantly Nav1.2. Binding affinity for batrachotoxin is greatly enhanced by the presence of co-activators in binding experiments and by depolarising prepulses in voltage-clamp experiments because of high affinity binding to the open/activated state. |
Inhibitors | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Gating inhibitors | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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View species-specific gating inhibitor tables | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gating Inhibitor Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Additional scorpion and sea anemone toxins act as inhibitors of fast inactivation of Nav1.2 channels at higher concentrations [21,30,52]. |
Channel Blockers | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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View species-specific channel blocker tables | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Channel Blocker Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
pIC50 values for lidocaine, etidocaine, lamotrigine and phenytoin reflect the Kd values for the resting state of sodium channels are 10 to 100-fold higher than for binding to open and inactivated sodium channels. Many other μ-conotoxins block Nav1.2 channels at higher concentrations [46]. |
Tissue Distribution | ||||||||
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Phenotypes, Alleles and Disease Models | Mouse data from MGI | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Clinically-Relevant Mutations and Pathophysiology | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Biologically Significant Variants | ||||||||||||||
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Biologically Significant Variant Comments | ||||||||||||||
The D209/N209 difference in the sequence for these two variants leads to a shift in the voltage dependence of Nav and altered response to epilepsy mutations [37-38,49]. |
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