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Target id: 621
Nomenclature: Estrogen receptor-β
Systematic Nomenclature: NR3A2
Family: 3A. Estrogen receptors
Gene and Protein Information | |||||
Species | AA | Chromosomal Location | Gene Symbol | Gene Name | Reference |
Human | 530 | 14q23.2-q23.3 | ESR2 | estrogen receptor 2 | 22 |
Mouse | 530 | 12 33.52 cM | Esr2 | estrogen receptor 2 (beta) | 33 |
Rat | 530 | 6q24 | Esr2 | estrogen receptor 2 | 12 |
Previous and Unofficial Names |
Erb2 | nuclear receptor subfamily 3 group A member 2 | ERβ | Erb | Estrb | estrogen receptor 2 (ER beta) |
Database Links | |
Alphafold | Q92731 (Hs), O08537 (Mm), Q62986 (Rn) |
CATH/Gene3D | 3.30.50.10 |
ChEMBL Target | CHEMBL242 (Hs), CHEMBL2995 (Mm), CHEMBL3021 (Rn) |
DrugBank Target | Q92731 (Hs) |
Ensembl Gene | ENSG00000140009 (Hs), ENSMUSG00000021055 (Mm), ENSRNOG00000005343 (Rn) |
Entrez Gene | 2100 (Hs), 13983 (Mm), 25149 (Rn) |
Human Protein Atlas | ENSG00000140009 (Hs) |
KEGG Gene | hsa:2100 (Hs), mmu:13983 (Mm), rno:25149 (Rn) |
OMIM | 601663 (Hs) |
Pharos | Q92731 (Hs) |
RefSeq Nucleotide | NM_001040276 (Hs), NM_207707 (Mm), NM_010157 (Mm), NM_012754 (Rn) |
RefSeq Protein | NP_001428 (Hs), NP_997590 (Mm), NP_036886 (Rn) |
SynPHARM |
6522 (in complex with 17β-estradiol) 6523 (in complex with genistein) 6532 (in complex with R,R-THC) |
UniProtKB | Q92731 (Hs), O08537 (Mm), Q62986 (Rn) |
Wikipedia | ESR2 (Hs) |
Selected 3D Structures | |||||||||||||
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Natural/Endogenous Ligands |
17β-estradiol |
estrone |
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Agonists | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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View species-specific agonist tables | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Agonist Comments | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ethinyl estradiol is selective for estrogen receptor α, where its affinity is 2nM [10]. |
Antagonists | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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DNA Binding | |||||||
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Co-binding Partners | |||
Name | Interaction | Effect | Reference |
AP1 | Physical, Functional | Transcriptional activation | 32 |
SP1 | Physical, Functional | DNA binding, Transcriptional activation | 27 |
HSP90 | Physical, Functional | Cellular localization, DNA binding | 4 |
Main Co-regulators | ||||||
Name | Activity | Specific | Ligand dependent | AF-2 dependent | Comments | References |
NCOA1 | Co-activator | No | Yes | Yes | 7 | |
NCOA2 | Co-activator | No | Yes | Yes | 7 | |
NCOA3 | Co-activator | No | Yes | Yes | 7 | |
EP300 | Co-activator | No | Yes | Yes | 7 | |
CREBBP | Co-activator | No | Yes | Yes | 7 | |
MED1 | Co-activator | No | Yes | Yes | 7 | |
DDX5 | Co-activator | No | Yes | No | 7 | |
SRA1 | Co-activator | No | Yes | No | 7 | |
NCOR1 | Co-repressor | No | Yes | No | 7 | |
NRIP1 | Co-repressor | No | Yes | Yes | Competes with AF-2 cofactor binding | 7 |
Main Target Genes | |||||
Name | Species | Effect | Technique | Comments | References |
TFF1 | Human | Activated | ChIP, Transient transfection, EMSA | 1 | |
PGR | Human | Activated | Footprint, Transient transfection,EMSA | 24 | |
LFT | Human | Activated | Footprint, Transient transfection,ChIP | 6 | |
CTSD | Human | Activated | Transient transfection, EMSA | 36 |
Functional Assays | ||||||||||
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Physiological Consequences of Altering Gene Expression | ||||||||||
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Phenotypes, Alleles and Disease Models | Mouse data from MGI | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Biologically Significant Variants | ||||||||
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